Uma perda muito importante da biodiversidade pode ocorrer na região.  Isso porque algumas espécies presentes no bioma podem ser pouco tolerantes a uma quantidade menor de chuva, e começar a desaparecer.  Assim como outras espécies são mais tolerantes a um nível alto de saturação do ponto de vista da temperatura que outras, e essas menos tolerantes podem deixar de existir.  Dessa forma necessariamente vai haver uma redução da biodiversidade que pode ter impactos importantes também sobre o ecossistema porque uma das chaves da sustentabilidade da floresta amazônica está justamente em sua altíssima taxa de biodiversidade.  Cada ser vivo depende de uma cadeia muito específica de outros para se manter viva, um número enorme de variáveis diferentes afetam a sustentabilidade do ecossistema e um deles é ter uma alta taxa de biodiversidade.

Na medida em que o ecossistema sofre um estresse muito maior e nele se reduz a biodiversidade e a produtividade primária (a taxa de fotossíntese) se alteram praticamente todas as propriedades daquele ecossistema transformando-o em outro que não se pode dizer que seja mais ou menos adequado à utilização humana.  Mas essa questão vai depender muito também da dinâmica econômica e social da região e de como isso vai evoluir nas próximas décadas.

Primeiro controlando o desmatamento e queimadas, que jogam na atmosfera grandes quantidades de gases de efeito estufa, e com o investimento maciço em reflorestamento em áreas desmatadas em toda sua extensão.  Isso é viável e pode resultar num efeito muito positivo pela elevação do seqüestro de carbono realizado pela floresta amazônica.

Qual o papel real da Amazônia como reguladora do clima?

O ecossistema amazônico, por sua localização em uma região tropical, tem uma importância estratégica no clima global especialmente do ponto de vista da emissão de vapor de água e de outros gases e partículas em geral em grandes quantidades.  Mesmo não sendo o único regulador do clima mundial, pelo fato de ser um ecossistema com fluxo muito intenso de vapor de água para a atmosfera acaba tendo maior importância para o clima do que os ecossistemas temperados.  A Amazônia é responsável pela maior parte de vapor de água que forma as chuvas em toda região sul, por exemplo.  Portanto, se você desmatar uma fração significativa da floresta vai haver um impacto importante na precipitação e consequentemente no clima do sul do país.

Na medida em que aumenta a temperatura na região e se espera uma redução significativa da taxa de precipitação no ecossistema amazônico, podemos ter a Amazônia cada vez mais parecida com uma savana.  Uma das diferenças climáticas mais importantes entre a região central do país e a região amazônica, por exemplo, é que chove três mil milímetros [anuais] na Amazônia enquanto chove 700 milímetros na parte central do Brasil.  Então a quantidade de precipitação é fundamental para o tipo de ecossistema que será capaz de se desenvolver naquela região.  Nenhuma floresta tropical com precipitação menor que mil milímetros pode se sustentar.  Dessa maneira se deixa de viabilizar a existência de uma floresta tropical como a que se conhece hoje.

O agronegócio vai se modificar pelo aumento da temperatura e pela diminuição na taxa de precipitação e isso não só o agronegócio que avança sobre a Amazônia, mas em todo o Brasil central.  A verdade é que se esperam grandes mudanças em todo o panorama agropecuário brasileiro, mas é impossível precisar o que, como vai e onde isso vai ocorrer.  Sem sombra de dúvidas esses fenômenos vão gerar alterações profundas para a economia do agronegócio.  Na região amazônica, as mudanças na agropecuária serão ainda mais importantes por afetar diretamente uma região de frágil equilíbrio ambiental.

O futuro da região amazônica depende das políticas públicas que o governo consiga implantar na região nos próximos anos

Se o governo conseguir implantar uma política real de combate ao desmatamento, a floresta ainda vai sofrer um dano significativo pela redução da taxa de precipitação e pelo aumento da temperatura.  Mas esse dano será minimizado se, por exemplo, consigam manter preservadas as bordas da floresta tropical.  Isso porque se você desmata toda a região sul e leste da Amazônia, você torna sua parte central mais suscetível às mudanças globais.  Caso o governo não dê conta de implantar políticas efetivas para conter o desmatamento e para a preservação e mitigação do aquecimento na região amazônica, dependendo da intensidade do processo, se pode esperar que uma área significativa da Amazônia seja destruída, e um ecossistema se destruído não pode ser recuperado.